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#microbial-ecology
3本の記事
- 🛡️ 定着抵抗性を1菌で取り戻す研究
Nature 2015、Buffie らの精密マイクロバイオーム再構成。抗菌薬で崩れた腸から特定の1菌（Clostridium scindens）を戻すと、胆汁酸代謝を介してC. difficileの定着抵抗性が回復するという機序を、土壌生態系のアナロジーで読み解く。
- 🦠 FMTの原理と適用を読み解く総説
Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology 2016。Khoruts & Sadowsky による糞便微生物移植（FMT）の作用機序と臨床適用の総説を解説。なぜ「他人の生態系を丸ごと移す」治療が再発性C. difficile感染症に劇的に効くのか、その原理を土壌の生態系修復のアナロジーで読み解く。
- 💊 抗菌薬後の腸はどう戻るか
Nature Microbiology 2018。Palleja らは健康な成人12名に最終手段クラスの抗菌薬3剤を4日間投与し、半年間の腸内細菌叢の崩壊と回復を追跡した。腸内細菌叢は約1.5ヶ月で近似的に回復する一方、9種は180日後も多くで検出されず、耐性遺伝子（レジストーム）が回復過程を左右したと報告する。